Hầu hết các đối tượng trong GeoGebra có thể bị xóa bởi một nhấp chuột đơn giản phải và sau đó lựa chọn các điểm ở tất cả. Đây cũng là công cụ Pen, nơi bạn chỉ cần nhấp chuột phải vào dòng bút chì và chọn mục trình đơn 'Delete'.