GeoGebra har en myriade av kommandoer, som kan skrives i fx input-feltet. Med disse kommandoene kan du få GeoGebra til å automatisk beregne ting, Som i det siste tok svært lang tid og krevde, at du kan sette inn og bruke noen veldig store formler.
Et eksempel
Ta for eksempel å måtte finne røttene til en kvadratisk funksjon med regelen f(x)= 2x ^ 2 3 x 2, som krever, at du kan sette inn i formler
og 
Dette håndteres i GeoGebra ved først å skrive regelen i boksen, og deretter skriver du kommandoen root[f]
2x ^ 2 3 x 2 [f]
Du kan få en liste over kommandoer inkludert.
Danske kommandoer – Ikke alle kommandoer er oversatt til dansk
wiki.geogebra.org / da / kategori:Kommandoer